2009年5月21日起，116路再次调整临时线路走向。

由恒大城至大悦城方向，原调流方案走宁山中路、北陵大街、北京街、北站路，敬宾街原线，现调流方案调整为走宁山中路、宁山东路、黑龙江街、岐山东路、北陵大街、北京街、北站路，敬宾街原线。

恢复“地质局、北陵电影院、龙江广场”3个既有站位，保留“省公安厅、昆山东路、北京街”3个临时站位，并继续取消“沈阳北站北”1个站位。

由大悦城至恒大城方向的线路走向和站位不变，仍然按原调流方案行驶。

自2009年4月16日起，因松花江街/敬宾街封路施工而临时改线的15条公交线路给沿线市民的出行带来了一定程度的影响。但交通局公交指挥调度中心本着方便市民、服务市民的宗旨，对15条临时绕行的线路做了合理、周密的规划部署，并提前将调流方案公布于众。在封路以后，根据路面交通情况、市民需求情况等综合考虑，交通局先后对116、228、236、265、271、325、328、399等调流线路进行二次调流，甚至多次调流，尽可能的满足各个受影响区域的市民出行，并对北京街等主要车站进行站位调整，保证道路畅通、公交畅通。各条线路所在的车队及公交公司也积极调研沿途路况，采用增加临时停靠站、增加区间快车、增加高峰车次等多重方案，将公交调流对市民出行的影响降至最低。